Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
N4BP3O15049 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
N4BP3O15049 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms