Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FOXN3O00409 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXN3O00409 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXN3O00409 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXN3O00409 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXN3O00409 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXN3O00409 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXN3O00409 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXN3O00409 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXN3O00409 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXN3O00409 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FOXN3O00409 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXN3O00409 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms