Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RCCD1A6NED2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RCCD1A6NED2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms