Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT87PA6NCN2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT87PA6NCN2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms