Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LEMD3Q9Y2U8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LEMD3Q9Y2U8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms