Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDP1Q9P0J1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PDP1Q9P0J1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.7 ms