Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CITED2Q99967 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CITED2Q99967 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms