Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TIMM23BQ5SRD1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TIMM23BQ5SRD1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms