Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SOHLH1Q5JUK2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOHLH1Q5JUK2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms