Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ME3Q16798 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ME3Q16798 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME3Q16798 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME3Q16798 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME3Q16798 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME3Q16798 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME3Q16798 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME3Q16798 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME3Q16798 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME3Q16798 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME3Q16798 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME3Q16798 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME3Q16798 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME3Q16798 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ME3Q16798 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ME3Q16798 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME3Q16798 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME3Q16798 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME3Q16798 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME3Q16798 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME3Q16798 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME3Q16798 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME3Q16798 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ME3Q16798 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME3Q16798 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME3Q16798 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME3Q16798 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME3Q16798 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME3Q16798 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME3Q16798 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME3Q16798 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME3Q16798 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME3Q16798 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ME3Q16798 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME3Q16798 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME3Q16798 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME3Q16798 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME3Q16798 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME3Q16798 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME3Q16798 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ME3Q16798 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME3Q16798 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME3Q16798 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME3Q16798 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME3Q16798 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME3Q16798 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME3Q16798 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME3Q16798 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ME3Q16798 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME3Q16798 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME3Q16798 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME3Q16798 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME3Q16798 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME3Q16798 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME3Q16798 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME3Q16798 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME3Q16798 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME3Q16798 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME3Q16798 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ME3Q16798 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME3Q16798 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME3Q16798 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME3Q16798 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME3Q16798 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME3Q16798 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ME3Q16798 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME3Q16798 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ME3Q16798 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME3Q16798 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ME3Q16798 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME3Q16798 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME3Q16798 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME3Q16798 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME3Q16798 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ME3Q16798 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME3Q16798 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME3Q16798 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME3Q16798 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME3Q16798 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME3Q16798 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ME3Q16798 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ME3Q16798 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ME3Q16798 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ME3Q16798 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ME3Q16798 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ME3Q16798 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ME3Q16798 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ME3Q16798 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME3Q16798 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ME3Q16798 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME3Q16798 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME3Q16798 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME3Q16798 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME3Q16798 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME3Q16798 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME3Q16798 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ME3Q16798 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME3Q16798 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ME3Q16798 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
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