Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSHL1Q14406 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSHL1Q14406 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
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