Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HSPB3Q12988 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HSPB3Q12988 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms