Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC35.71■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
GRIN2AQ12879 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC35.68■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
GRIN2AQ12879 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GRIN2AQ12879 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
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