Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPIRE1Q08AE8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPIRE1Q08AE8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms