Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC63Q05C16 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LRRC63Q05C16 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms