Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH15P55291 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH15P55291 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH15P55291 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH15P55291 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH15P55291 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CDH15P55291 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CDH15P55291 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH15P55291 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH15P55291 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH15P55291 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH15P55291 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH15P55291 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH15P55291 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH15P55291 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH15P55291 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH15P55291 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH15P55291 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH15P55291 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH15P55291 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH15P55291 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CDH15P55291 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH15P55291 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH15P55291 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH15P55291 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH15P55291 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH15P55291 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH15P55291 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH15P55291 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH15P55291 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH15P55291 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH15P55291 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH15P55291 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH15P55291 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH15P55291 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH15P55291 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH15P55291 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CDH15P55291 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH15P55291 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH15P55291 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH15P55291 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH15P55291 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH15P55291 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH15P55291 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH15P55291 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH15P55291 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH15P55291 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDH15P55291 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDH15P55291 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDH15P55291 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH15P55291 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH15P55291 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH15P55291 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH15P55291 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH15P55291 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH15P55291 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH15P55291 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH15P55291 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH15P55291 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDH15P55291 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDH15P55291 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms