Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS1P54277 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS1P54277 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS1P54277 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS1P54277 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PMS1P54277 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMS1P54277 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PMS1P54277 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PMS1P54277 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PMS1P54277 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PMS1P54277 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMS1P54277 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PMS1P54277 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMS1P54277 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PMS1P54277 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMS1P54277 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PMS1P54277 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMS1P54277 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS1P54277 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS1P54277 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS1P54277 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS1P54277 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS1P54277 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS1P54277 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS1P54277 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS1P54277 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS1P54277 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS1P54277 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS1P54277 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS1P54277 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS1P54277 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS1P54277 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS1P54277 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS1P54277 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS1P54277 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS1P54277 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS1P54277 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS1P54277 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS1P54277 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS1P54277 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS1P54277 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS1P54277 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS1P54277 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMS1P54277 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMS1P54277 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMS1P54277 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMS1P54277 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PMS1P54277 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMS1P54277 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMS1P54277 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMS1P54277 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMS1P54277 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMS1P54277 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS1P54277 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS1P54277 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS1P54277 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS1P54277 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS1P54277 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS1P54277 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS1P54277 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS1P54277 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS1P54277 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS1P54277 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS1P54277 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS1P54277 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS1P54277 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PMS1P54277 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PMS1P54277 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PMS1P54277 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PMS1P54277 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS1P54277 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS1P54277 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS1P54277 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS1P54277 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS1P54277 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS1P54277 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS1P54277 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS1P54277 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS1P54277 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS1P54277 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS1P54277 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS1P54277 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS1P54277 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS1P54277 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS1P54277 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS1P54277 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS1P54277 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS1P54277 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS1P54277 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS1P54277 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS1P54277 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS1P54277 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS1P54277 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS1P54277 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS1P54277 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS1P54277 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS1P54277 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS1P54277 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS1P54277 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS1P54277 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms