Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF4A3P38919 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms