Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH5P33151 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH5P33151 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH5P33151 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH5P33151 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH5P33151 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH5P33151 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH5P33151 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH5P33151 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH5P33151 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH5P33151 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH5P33151 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH5P33151 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH5P33151 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH5P33151 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH5P33151 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH5P33151 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH5P33151 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH5P33151 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH5P33151 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH5P33151 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH5P33151 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH5P33151 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH5P33151 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH5P33151 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH5P33151 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH5P33151 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH5P33151 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH5P33151 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH5P33151 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH5P33151 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH5P33151 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH5P33151 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH5P33151 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH5P33151 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH5P33151 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH5P33151 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH5P33151 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH5P33151 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH5P33151 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH5P33151 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH5P33151 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH5P33151 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH5P33151 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH5P33151 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH5P33151 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH5P33151 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH5P33151 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH5P33151 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH5P33151 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH5P33151 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH5P33151 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH5P33151 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH5P33151 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH5P33151 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH5P33151 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH5P33151 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH5P33151 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH5P33151 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH5P33151 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH5P33151 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH5P33151 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH5P33151 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH5P33151 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH5P33151 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH5P33151 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH5P33151 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH5P33151 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH5P33151 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH5P33151 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH5P33151 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH5P33151 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH5P33151 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH5P33151 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH5P33151 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH5P33151 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH5P33151 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH5P33151 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH5P33151 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH5P33151 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH5P33151 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH5P33151 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDH5P33151 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms