Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
EFNA1P20827 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
EFNA1P20827 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms