Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PABPC1P11940 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PABPC1P11940 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms