Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNE2O96020 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNE2O96020 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNE2O96020 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 296.6 ms