Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB6O95452 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB6O95452 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB6O95452 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB6O95452 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB6O95452 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB6O95452 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB6O95452 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB6O95452 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB6O95452 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB6O95452 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB6O95452 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB6O95452 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB6O95452 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB6O95452 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB6O95452 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB6O95452 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB6O95452 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB6O95452 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB6O95452 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB6O95452 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB6O95452 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB6O95452 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB6O95452 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB6O95452 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB6O95452 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB6O95452 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB6O95452 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB6O95452 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB6O95452 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB6O95452 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB6O95452 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB6O95452 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GJB6O95452 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GJB6O95452 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB6O95452 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB6O95452 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB6O95452 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB6O95452 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB6O95452 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB6O95452 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB6O95452 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB6O95452 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB6O95452 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB6O95452 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB6O95452 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB6O95452 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB6O95452 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB6O95452 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB6O95452 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB6O95452 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB6O95452 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB6O95452 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB6O95452 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB6O95452 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB6O95452 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB6O95452 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB6O95452 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB6O95452 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB6O95452 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB6O95452 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB6O95452 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB6O95452 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms