Protein–RNA interactions for Protein: O60285

NUAK1, NUAK family SNF1-like kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUAK1O60285 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NUAK1O60285 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUAK1O60285 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUAK1O60285 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUAK1O60285 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUAK1O60285 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUAK1O60285 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUAK1O60285 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUAK1O60285 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUAK1O60285 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUAK1O60285 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUAK1O60285 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUAK1O60285 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NUAK1O60285 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NUAK1O60285 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms