Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SMCO3A2RU48 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SMCO3A2RU48 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms