Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LEMD3Q9Y2U8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LEMD3Q9Y2U8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms