Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC17A6Q9P2U8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC17A6Q9P2U8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC17A6Q9P2U8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC17A6Q9P2U8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC17A6Q9P2U8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC17A6Q9P2U8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC17A6Q9P2U8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC17A6Q9P2U8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC17A6Q9P2U8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC17A6Q9P2U8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC17A6Q9P2U8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC17A6Q9P2U8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC17A6Q9P2U8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC17A6Q9P2U8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC17A6Q9P2U8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC17A6Q9P2U8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms