Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN7L3BQ96GX2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATXN7L3BQ96GX2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN7L3BQ96GX2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN7L3BQ96GX2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN7L3BQ96GX2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN7L3BQ96GX2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN7L3BQ96GX2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATXN7L3BQ96GX2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATXN7L3BQ96GX2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms