Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RUBCNQ92622 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RUBCNQ92622 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms