Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CRIP3Q6Q6R5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CRIP3Q6Q6R5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms