Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEZ8

PODNL1, Podocan-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODNL1Q6PEZ8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PODNL1Q6PEZ8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PODNL1Q6PEZ8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms