Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRRT3Q5FWE3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRRT3Q5FWE3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms