Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
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COL24A1Q17RW2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
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COL24A1Q17RW2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COL24A1Q17RW2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
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COL24A1Q17RW2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL24A1Q17RW2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
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COL24A1Q17RW2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL24A1Q17RW2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
COL24A1Q17RW2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
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COL24A1Q17RW2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL24A1Q17RW2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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COL24A1Q17RW2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL24A1Q17RW2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
COL24A1Q17RW2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL24A1Q17RW2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL24A1Q17RW2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
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COL24A1Q17RW2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL24A1Q17RW2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL24A1Q17RW2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
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COL24A1Q17RW2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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COL24A1Q17RW2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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COL24A1Q17RW2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL24A1Q17RW2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL24A1Q17RW2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL24A1Q17RW2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
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COL24A1Q17RW2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL24A1Q17RW2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
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