Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDKN3Q16667 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDKN3Q16667 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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