Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
EEA1Q15075 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
EEA1Q15075 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.33
EEA1Q15075 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
EEA1Q15075 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
EEA1Q15075 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
EEA1Q15075 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
EEA1Q15075 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
EEA1Q15075 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
EEA1Q15075 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
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