Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RFTN1Q14699 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFTN1Q14699 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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