Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM3AP98173 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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FAM3AP98173 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FAM3AP98173 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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FAM3AP98173 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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FAM3AP98173 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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FAM3AP98173 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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FAM3AP98173 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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FAM3AP98173 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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FAM3AP98173 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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FAM3AP98173 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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FAM3AP98173 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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FAM3AP98173 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FAM3AP98173 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
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