Protein–RNA interactions for Protein: P46020

PHKA1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKA1P46020 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKA1P46020 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKA1P46020 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms