Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCG1P45844 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCG1P45844 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms