Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ITGAEP38570 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
ITGAEP38570 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ITGAEP38570 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms