Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMB4P28070 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMB4P28070 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms