Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HNF1AP20823 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms