Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DMDP11532 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMDP11532 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMDP11532 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMDP11532 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMDP11532 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMDP11532 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMDP11532 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMDP11532 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMDP11532 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMDP11532 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMDP11532 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMDP11532 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DMDP11532 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DMDP11532 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DMDP11532 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
DMDP11532 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DMDP11532 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DMDP11532 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DMDP11532 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DMDP11532 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DMDP11532 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DMDP11532 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DMDP11532 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DMDP11532 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DMDP11532 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DMDP11532 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DMDP11532 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DMDP11532 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DMDP11532 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DMDP11532 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DMDP11532 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DMDP11532 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DMDP11532 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DMDP11532 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DMDP11532 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DMDP11532 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DMDP11532 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DMDP11532 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
DMDP11532 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DMDP11532 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DMDP11532 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DMDP11532 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
DMDP11532 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMDP11532 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMDP11532 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMDP11532 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMDP11532 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMDP11532 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMDP11532 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMDP11532 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DMDP11532 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMDP11532 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DMDP11532 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMDP11532 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DMDP11532 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMDP11532 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMDP11532 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMDP11532 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMDP11532 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMDP11532 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMDP11532 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMDP11532 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMDP11532 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMDP11532 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DMDP11532 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DMDP11532 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DMDP11532 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DMDP11532 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DMDP11532 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DMDP11532 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DMDP11532 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DMDP11532 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DMDP11532 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DMDP11532 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DMDP11532 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DMDP11532 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DMDP11532 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DMDP11532 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DMDP11532 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DMDP11532 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DMDP11532 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DMDP11532 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DMDP11532 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DMDP11532 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DMDP11532 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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