Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB1P08034 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB1P08034 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB1P08034 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GJB1P08034 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB1P08034 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB1P08034 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB1P08034 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB1P08034 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB1P08034 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB1P08034 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB1P08034 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB1P08034 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB1P08034 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB1P08034 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GJB1P08034 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJB1P08034 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJB1P08034 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GJB1P08034 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB1P08034 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB1P08034 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB1P08034 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB1P08034 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB1P08034 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB1P08034 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GJB1P08034 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB1P08034 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB1P08034 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB1P08034 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB1P08034 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB1P08034 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB1P08034 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB1P08034 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB1P08034 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB1P08034 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB1P08034 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB1P08034 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB1P08034 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB1P08034 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB1P08034 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GJB1P08034 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB1P08034 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB1P08034 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB1P08034 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB1P08034 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB1P08034 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB1P08034 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB1P08034 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB1P08034 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB1P08034 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB1P08034 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB1P08034 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB1P08034 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GJB1P08034 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GJB1P08034 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB1P08034 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB1P08034 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB1P08034 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB1P08034 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB1P08034 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB1P08034 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB1P08034 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB1P08034 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB1P08034 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB1P08034 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB1P08034 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB1P08034 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GJB1P08034 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB1P08034 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB1P08034 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB1P08034 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB1P08034 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB1P08034 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB1P08034 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB1P08034 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB1P08034 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB1P08034 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB1P08034 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB1P08034 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB1P08034 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB1P08034 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB1P08034 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 323.4 ms