Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM3P06753 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM3P06753 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM3P06753 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM3P06753 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM3P06753 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM3P06753 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM3P06753 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM3P06753 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM3P06753 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM3P06753 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM3P06753 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM3P06753 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM3P06753 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TPM3P06753 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM3P06753 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM3P06753 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM3P06753 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM3P06753 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM3P06753 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM3P06753 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM3P06753 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM3P06753 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TPM3P06753 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPM3P06753 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TPM3P06753 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM3P06753 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM3P06753 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM3P06753 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM3P06753 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TPM3P06753 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM3P06753 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM3P06753 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM3P06753 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM3P06753 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM3P06753 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM3P06753 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM3P06753 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM3P06753 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM3P06753 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM3P06753 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM3P06753 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM3P06753 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM3P06753 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM3P06753 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM3P06753 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM3P06753 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM3P06753 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM3P06753 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM3P06753 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM3P06753 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM3P06753 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM3P06753 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM3P06753 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM3P06753 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM3P06753 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM3P06753 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM3P06753 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM3P06753 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM3P06753 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM3P06753 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM3P06753 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM3P06753 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM3P06753 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM3P06753 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM3P06753 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM3P06753 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM3P06753 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM3P06753 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM3P06753 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM3P06753 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM3P06753 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM3P06753 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM3P06753 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM3P06753 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM3P06753 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM3P06753 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM3P06753 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM3P06753 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM3P06753 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM3P06753 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM3P06753 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM3P06753 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM3P06753 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM3P06753 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM3P06753 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM3P06753 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM3P06753 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM3P06753 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM3P06753 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM3P06753 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM3P06753 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM3P06753 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM3P06753 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM3P06753 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM3P06753 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM3P06753 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM3P06753 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM3P06753 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM3P06753 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms