Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VPREB3Q9UKI3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms