Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
BSDC1Q9NW68 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BSDC1Q9NW68 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BSDC1Q9NW68 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms