Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GSDMCQ9BYG8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GSDMCQ9BYG8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSDMCQ9BYG8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSDMCQ9BYG8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSDMCQ9BYG8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSDMCQ9BYG8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSDMCQ9BYG8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSDMCQ9BYG8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms