Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C1QTNF1Q9BXJ1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms