Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRNP25Q9BV90 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNRNP25Q9BV90 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP25Q9BV90 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms